Efter en mållös första halvlek var Skeninge starkare i andra halvlek.
Skeninges tre mål gjordes av Sigge Hörbäck, Victor Swartz och Olle Torbjörnsson.
För tabellens utseende betyder det här att Vadstena ligger på elfte och sista plats medan Skeninge har sjundeplatsen.
Vadstena tar sig an Mjölby Södra i nästa match borta lördag 11 september 15.00.