Agüero ska ha haft ont i bröstet under stora delar av första halvlek och ersattes av Philippe Coutinho i halvtid för att föras till sjukhus och en hjärtundersökning.
Nu skriver spanska tidningen Sport att orsaken var arytmi, rubbningar i hjärtrytmen, och argentinaren kommer att hållas kvar på sjukhus för vidare undersökningar. Han ska dock må bra efter omständigheterna.
Agüero har haft liknande problem förut och drabbades av arytmi redan som 12-åring.