Sedan tidigare har nödläge utlysts i Timaru District, Ashburton och Selwyn.
De som nu evakueras i Waimakariri tvingas lämna sina hem eftersom de ligger nära de översvämmade floderna Eyre och Ashley, och det finns risk att skyddsvallarna inte håller för vattenmassorna, rapporterar tidningen NZ Herald.
Enligt landets vädermyndighet Metservice väntas mer dåligt väder i regionen och fler områden planerar för ytterligare evakueringar, speciellt nära Ashburton River.
– Regnet kommer att fortsätta minst till i morgon. Det kommer att vara kraftigt och myndigheterna kommer att hålla uppsikt över vattennivåerna i kväll, säger Kris Faafoi, tillförordnad minister för krishantering, rapporterar nyhetsbyrån Reuters.
Enligt Ashburtons borgmästare finns det risk att runt 4 000 invånare där måste evakueras.
I Canterburys huvudstad Christchurch väntas ytterligare runt 100 mm regn.