Fiskebåten och dess 30 man starka besättning attackerades på onsdagen. Fem sydkoreanska medborgare och en ghanan kidnappades.
För närvarande är kidnapparnas identitet samt var de fört fiskarna okänt, uppger Sydkoreas utrikesdepartement.
Internationella sjöfartsbyrån uppmanar alla fartyg i området att vara vaksamma. Guineabukten har blivit ett centrum för pirater som plundrar fartyg och kidnappar besättningsmän i utbyte mot lösensummor. Många av piraterna tros komma från Nigeria.
Bukten sträcker sig från Senegal till Angola och har en kuststräcka på runt 570 mil.