Enligt delstatsåklagaren Gerardo Solís Gómez har ett stort antal redan identifierats och kunnat överlämnas till anhöriga.
De flesta av massgravarna har legat på inhägnade områden eller på övergivna bondgårdar i storstadsområdet.
Antalet kroppar kommat att öka, för fem platser har ännu inte undersökts, till följd av personalbrist.